À partir du 2 novembre 2026, les premiers docteurs juniors (DJ) de médecine générale rejoindront les centres de santé, les maisons de santé et les cabinets de groupe, pour la quatrième année du DES, dite "phase de consolidation". Pour vous aider à préparer l’accueil des DJ dans vos centres de santé, nous avons regroupé ci-dessous les informations essentielles ainsi que les sources officielles à consulter.

Organisation et financement pour accueillir un docteur junior en centre de santé


Organisation : 

  • Le DJ exerce au sein du centre de santé en autonomie supervisée par un praticien agréé en qualité de maître de stage des universités (PAMSU) identifié.
  • Les actes sont réalisés dans le cadre de l'organisation habituelle de la structure.

  • Pour préparer l’accueil des docteurs juniors au sein de votre centre de santé, vérifiez auprès de vos éditeurs que vos logiciels sont prêts : ils doivent permettre la facturation avec la carte CPF du docteur junior et l'identification des remboursements liés à son activité.

  • La facturation suit les règles de la structure, avec possibilité de tiers payant intégral (voir encadré ci-dessous).

Répartition des flux financiers :

  • Honoraires pédagogiques :  600 € par mois et par DJ, versés par l’université au PAMSU.
  • Prime ZIP / ZAC / QPV : 800 € par mois et par DJ, versée au centre de santé par l’Assurance Maladie.
  • Supervision PDSA : 400 € par mois, versée au centre de santé par l’Assurance Maladie
    Attention : il faudra prévoir les modalités de reversement de cette indemnité par le centre au PAMSU via un accord avec son salarié, ou en application du statut COSP (Collaborateur Occasionnel de Service Public).
Compensation forfaitaire pour forte patientèle exonérée ou pour activité dans le Haut-Rhin, le Bas-Rhin ou la Moselle
Le praticien agréé-maître de stage des universités accueillant, au sein d’une structure de soins de premiers recours, des docteurs juniors en médecine générale perçoit, le cas échéant, une rémunération supplémentaire aux honoraires pédagogiques mentionnés à l’article 4, composée :

1. De primes conditionnelles (...)

2. D’une compensation forfaitaire, si, au cours de l’année précédant l’accueil du docteur junior, la part de la patientèle du praticien agréé-maître de stage des universités, ou celle de la structure de soins de premiers recours dans laquelle il exerce, bénéficiant d’une exonération de la participation prévue au I de l’article L. 160-13 du code de la sécurité sociale ou d’une prise en charge de cette participation au titre de l’article L. 861-3 du code de la sécurité sociale, dans sa patientèle totale, dépasse un certain seuil. Cette compensation est la suivante : 
Si cette part est comprise entre 50 % et 63 %, le montant de la compensation est fixé à 300 euros bruts par mois d’accueil d’un docteur junior
Si cette part est égale ou supérieure à 63 %, le montant de la compensation est fixé à 600 euros bruts par mois d’accueil d’un docteur junior

3. D’une compensation forfaitaire de 550 euros bruts par mois d’accueil d’un docteur junior, pour le praticien agréé-maître de stage dont le cabinet principal est situé dans les départements du Haut-Rhin, du Bas-Rhin ou de la Moselle. (...)

Lorsque le praticien agréé maître de stage des universités accueille le docteur junior dans le cadre d'une activité salariée pour un centre de santé ou une maison de santé pluriprofessionnelle, les rémunérations mentionnées au présent article sont dues à la personne morale employeur.

Circuits de financement pour les centres de santé : 
Pour les actes réalisés par le docteur junior, le centre de santé perçoit, comme pour les actes réalisés par ses autres médecins, la part de l'Assurance Maladie obligatoire (AMO) et la part complémentaire (AMC, ou ticket modérateur). La part complémentaire reste acquise au centre de santé, tandis que la part obligatoire doit être restituée à l’Assurance Maladie sous forme d’indus. Le décret fixant les modalités de cette restitution est en attente de publication.

Attention : compte tenu du circuit de restitution de la part AMO de l’activité du docteur junior, les centres de santé devront prévoir ce remboursement dans leur budget.

 

Où trouver les informations ?


Les textes officiels

Le texte de référence pour la mise en œuvre est l'instruction interministérielle du 21 mai 2026, c'est le premier document à consulter. Les textes publiés au Journal officiel sont consultables sur Légifrance en recherchant leur intitulé.

  • Instruction interministérielle du 21 mai 2026 relative à la mise en œuvre de la quatrième année du diplôme d’études spécialisées (DES) de médecine générale

Cette instruction précise les modalités de la mise en œuvre de la 4e année : statut, organisation des stages, agrément, appariement, PDSA, rémunérations, conditions d’accueil et de formation, gouvernance.

  • Décret n° 2026-704 et arrêté du 30 juillet 2026

Ces textes définissent les modalités de choix des stages des docteurs juniors au niveau de la subdivision ainsi que les règles de classement des candidats par les PAMSU.

  • Décret n° 2026-370 et arrêté du 13 mai 2026

Ces textes précisent les modalités d’indemnisation des docteurs juniors participant à la permanence des soins ambulatoires (gardes, régulation).

  • Arrêté du 23 octobre 2026 (article R. 6153-1-5 du code de la santé publique)

Cet arrêté fixe la liste des spécialités pour lesquelles le docteur junior peut être autorisé à participer, à sa demande, au service des gardes et astreintes médicales.

  • Décret n° 2025-850 et arrêté du 27 août 2025

Ces textes définissent le régime indemnitaire des docteurs juniors : prime à l'activité, indemnité en zone d'intervention prioritaire.

  • Arrêté du 27 août 2025 (PAMSU)

Cet arrêté précise les modalités de rémunération des praticiens maîtres de stage accueillant un docteur junior.

  • Arrêté du 13 mai 2026 modifiant l'arrêté du 27 juin 2011 (PAMSU)

Cet arrêté révise les modalités de rémunération des PAMSU.


Les ressources de la filière


Vos interlocuteurs1

  • Votre ARS : questions stratégiques ou territoriales (pilote le déploiement régional, agrée les terrains de stage - 3e cycle, accompagne les territoires)
  • L’Assurance Maladie : questions de financement ou d’activité (contribue au financement du dispositif, assure le suivi de l’activité médicale, participe à la rémunération (tickets modérateurs, aides))
  • Facultés de médecine (UFR) : interlocuteurs clés pour les médecins souhaitant s’engager (délivrent les agréments – avec l’ARS, organisent la formation et le suivi pédagogique, accompagnent les médecins souhaitant devenir MSU)
  • Conseil de l’Ordre des médecins : point d’appui sur les aspects réglementaires (assure l’inscription des docteurs juniors, veille au respect des règles déontologiques).

 

[1] "Docteurs juniors en médecine générale : accueillir de futurs médecins", ARS Auvergne-Rhône-Alpes, 20 mai 2026, https://www.auvergne-rhone-alpes.ars.sante.fr/docteurs-juniors-en-medecine-generale-accueillir-de-futurs-medecins
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